论文查重软件与学术数据库是紧密相关的，它们的连接方式有多种。首先，可以直接在查重软件中输入学术数据库的账号密码进行连接；其次，可以通过学术数据库提供的API接口，实现软件与数据库的间接连接；还可以通过VPN等方式实现连接。总之，连接方式多种多样，需要根据具体情况选择合适的方式。

对于大多数用户来说，直接在查重软件中输入学术数据库的账号密码进行连接是最为常见和方便的方式。但是，对于一些特殊情况，比如学校网络限制等，可能需要采用其他方式，比如通过VPN实现连接。无论采用哪种方式，都需要保证连接的稳定性和安全性，以确保查重结果的准确性和可靠性。